Percepatan pembangunan Pelabuhan Wanam juga sejalan dengan agenda Asta Cita Presiden Prabowo Subianto. Agenda tersebut menitikberatkan pada upaya mewujudkan swasembada pangan serta pemerataan pembangunan nasional, khususnya di kawasan timur Indonesia dan wilayah terdepan, terluar, dan tertinggal (3T).
Dengan rampungnya Pelabuhan Wanam, Kemenhub optimistis konektivitas laut di Papua Selatan akan semakin kuat. Selain itu, biaya logistik diharapkan dapat ditekan, distribusi barang menjadi lebih efisien, dan pembangunan ekonomi berkelanjutan di wilayah tersebut dapat terus didorong.